Летище Bilbao Airport се обслужва от един терминал, който е просторен и много добре устроен. Разстоянията са малки и от входа на терминала до самолета можете да изминете не повече от 150 метра.
Приземният етаж е отделен за пристигащите, а на 1-вия етаж се намират гишетата за регистрация и единственият пункт за проверка на сигурността.
Транзитната зона е обща за всички полети. Паспортният контрол, отвъд който са изходите за заминаване за полетите извън Шенген, се намира след проверката за сигурност в близост до изход В15.
Интерактивна карта на всички терминали можете да намерите на официалния уебсайт на летището: www.aena.es/en